Mathematical model transcription of the operon: pilA
Generated  states: 7
Blocked states: 0
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variables:
1	PilR	;	0	0	activator
2	PilR	;	0	0	activator
3	PilR	;	0	0	activator
parameters: 28
V_0	;	Initial rate
a_basal	;	Basal activity
k_1	;	PilR activity
k_2	;	PilR activity
k_3	;	PilR activity
n_11	;	 PilR(#1)  Hill parameter
level_1	;	 PilR(#1) rate activity parameter
n_1h1	;	 PilR(#1)  Hill parameter
n_2h1	;	 PilR(#1) PilR(#2)  Hill parameter
w12	;	 cooperation parameter
level_12	;	 PilR(#1) PilR(#2)  activity parameter
n_1h2	;	 PilR(#1)  Hill parameter
n_2h2	;	 PilR(#1) PilR(#2)  Hill parameter
n_3h1	;	 PilR(#1) PilR(#2) PilR(#3)  Hill parameter
w123	;	 cooperation parameter
level_123	;	 PilR(#1) PilR(#2) PilR(#3)  activity parameter
n_1h3	;	 PilR(#1)  Hill parameter
n_3h2	;	 PilR(#1) PilR(#3)  Hill parameter
w13	;	 cooperation parameter
level_13	;	 PilR(#1) PilR(#3)  activity parameter
n_21	;	 PilR(#2)  Hill parameter
level_2	;	 PilR(#2) rate activity parameter
n_2h3	;	 PilR(#2)  Hill parameter
n_3h3	;	 PilR(#2) PilR(#3)  Hill parameter
w23	;	 cooperation parameter
level_23	;	 PilR(#2) PilR(#3)  activity parameter
n_31	;	 PilR(#3)  Hill parameter
level_3	;	 PilR(#3) rate activity parameter

Numerator = a_basal+(level_1*((PilR/k_1)^n_11))+(level_12*w12*((PilR/k_1)^n_1h1)*((PilR/k_2)^n_2h1))+(level_123*w123*((PilR/k_1)^n_1h2)*((PilR/k_2)^n_2h2)*((PilR/k_3)^n_3h1))+(level_13*w13*((PilR/k_1)^n_1h3)*((PilR/k_3)^n_3h2))+(level_2*((PilR/k_2)^n_21))+(level_23*w23*((PilR/k_2)^n_2h3)*((PilR/k_3)^n_3h3))+(level_3*((PilR/k_3)^n_31))
Denominator = 1+((PilR/k_1)^n_11)+(w12*(PilR/k_1)^n_1h1*(PilR/k_2)^n_2h1)+(w123*(PilR/k_1)^n_1h2*(PilR/k_2)^n_2h2*(PilR/k_3)^n_3h1)+(w13*(PilR/k_1)^n_1h3*(PilR/k_3)^n_3h2)+((PilR/k_2)^n_21)+(w23*(PilR/k_2)^n_2h3*(PilR/k_3)^n_3h3)+((PilR/k_3)^n_31)
f = V_0*Numerator/Denominator
